2023年4月20日凌晨零时，澳门海关及治安警察局等执法部门人员随即进驻，执行治安管理任务。经国务院批准，横琴口岸澳方口岸区及相关延伸区第二阶段客货车检区域（澳门大学连接横琴口岸通道桥除外），自当日凌晨零时起正式交付澳门特区使用，并依照澳门特区法律实施管辖。粤澳双方当日凌晨零时举行移交仪式。仪式上，深合区执委会副主任符永革宣读国务院有关批复，随后广东省政府横琴办副主任魏以军将横琴口岸澳方口岸区象征物（横琴口岸澳方口岸区模型）交予澳门海关关长黄文忠。仪式完结后，广东武警珠海支队及澳门海关人员随即驻守粤澳新边界线，执行边防及治安管理任务。
横琴口岸二期永久客货车道将采用“联合一站式”创新通关模式，届时进出境车辆只需一次排队，便可完成两地海关、边检及检验检疫程序，有效节省往来两地的通关时间。横琴口岸第二阶段相关区域移交澳门后，粤澳两地相关部门将继续推进通关设施设备的安装与联调联试，随后将进行通关压力测试及举行各类应急消防演习，以确保横琴口岸永久客货车通道及随车人员验放厅正式开通后安全、顺畅、高效运行。
粤方代表将象征物（横琴口岸澳方口岸区模型）交予澳方代表
在横琴口岸二期永久客货车通道正式开通前，通关车辆仍需使用目前的临时通关车道。横琴口岸澳方口岸区分三个阶段移交澳方管理，第一阶段旅检大楼及相关延伸区已于2020年3月18日移交澳门管理并于同年8月18日正式通关。是次移交澳方管理的口岸区属第二阶段客货车检区域。第三阶段属澳门轻轨延伸至横琴口岸区域，预计明年第四季完成建设。
